2020 - 2024

1. BPOM
2. Unit Pusat
3. Balai

2015 - 2019

1. BPOM
2. Unit Pusat
   • Deputi Bidang Pengawasan Obat, Narkotika, Psikotropika, Prekursor dan Zat Adiktif
   • Inspektorat II
   • Biro Perencanaan dan Keuangan
   • Biro Kerjasama
   • Direktorat Pengawasan Produksi Obat, Narkotika, Psikotropika dan Prekursor
   • Direktorat Pengawasan Keamanan, Mutu, dan Ekspor Impor Obat, Narkotika, Psikotropika, Prekursor dan Zat Adiktif
   • Direktorat Registrasi Obat Tradisional, Suplemen Kesehatan dan Kosmetik
   • Direktorat Standardisasi Pangan Olahan
   • Direktorat Pengawasan Pangan Risiko Tinggi dan Teknologi Baru
   • Direktorat Pemberdayaan Masyarakat dan Pelaku Usaha
   • Direktorat Intelijen
   • Direktorat Penyidikan
   • Direktorat Pengamanan
   ------------------------------------------------------------
   • Sekretariat Utama
   • Deputi Bidang Pengawasan OT, Kos dan PK
   • Deputi Bidang Pengawasan Keamanan Pangan dan Bahan Berbahaya
   • Inspektorat
   • Biro Umum
   • Biro Hukmas
   • Pusat Informasi Obat dan Makanan
   1. Rencana Strategis Pusat Informasi Obat dan Makanan
   2. Hasil Reviu atas Revisi Rencana Strategis Pusat Informasi Obat dan Makanan Tahun 2015-2019
   • Pusat Riset Obat dan Makanan
   • Pusat Pengujian Obat dan Makanan Nasional
   • Direktorat Penilaian Obat dan Produk Biologi
   • Direktorat Pengawasan Distribusi PT PKRT
   • Direktorat Pengawasan Produksi PT PKRT
   • Direktorat Standardisasi PT dan PKRT
   • Direktorat Pengawasan Napza
   • Direktorat OAI
   • Direktorat Standardisasi OT, Kos dan PK
   • Direktorat Insert OT, Kos dan PK
   • Direktorat Insert Pangan
   • Direktorat Pengawasan Produk dan Bahan Berbahaya
   • Direktorat Penilaian Keamanan Pangan
   • Direktorat Surveilan dan Peyuluhan Keamanan Pangan
3. Balai
   • Balai Besar POM di Banda Aceh
   • Balai Besar POM di Medan
   • Balai Besar POM di Padang
   • Balai Besar POM di Palembang
   • Balai Besar POM di Bandung
   • Balai Besar POM di Yogyakarta
   • Balai Besar POM di Surabaya
   • Balai Besar POM di Denpasar
   • Balai Besar POM di Mataram
   • Balai Besar POM di Manado
   • Balai Besar POM di Makassar
   • Balai Besar POM di Pontianak
   • Balai Besar POM di Banjarmasin
   • Balai Besar POM di Jakarta
   • Balai Besar POM di Jayapura
   • Balai Besar POM di Bandar Lampung
   • Balai Besar POM di Pekanbaru
   • Balai Besar POM di Samarinda
   • Balai Besar POM di Semarang
   • Balai POM di Batam
   • Balai POM di Jambi
   • Balai POM di Bengkulu
   • Balai POM di Pangkal Pinang
   • Balai POM di Kupang
   • Balai POM di Palangka Raya
   • Balai POM di Palu
   • Balai POM di Kendari
   • Balai POM di Manokwari
   • Balai POM di Sofifi
   • Balai POM di Ambon
   • Balai POM di Gorontalo
   • Balai POM di Serang
   • Balai POM di Mamuju